Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHLH1Q02575 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHLH1Q02575 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHLH1Q02575 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms