Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOSC10Q01780 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EXOSC10Q01780 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC10Q01780 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms