Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1DQ01668 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1DQ01668 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms