Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRCDQ00LT1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRCDQ00LT1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms