Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKOR1P84550 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms