Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HBBP68871 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HBBP68871 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HBBP68871 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HBBP68871 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HBBP68871 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HBBP68871 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HBBP68871 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HBBP68871 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HBBP68871 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HBBP68871 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HBBP68871 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HBBP68871 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HBBP68871 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HBBP68871 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HBBP68871 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HBBP68871 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HBBP68871 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HBBP68871 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HBBP68871 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HBBP68871 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HBBP68871 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HBBP68871 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HBBP68871 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HBBP68871 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HBBP68871 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HBBP68871 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HBBP68871 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HBBP68871 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HBBP68871 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HBBP68871 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HBBP68871 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HBBP68871 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HBBP68871 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HBBP68871 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HBBP68871 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HBBP68871 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HBBP68871 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HBBP68871 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HBBP68871 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HBBP68871 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HBBP68871 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HBBP68871 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HBBP68871 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HBBP68871 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HBBP68871 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HBBP68871 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HBBP68871 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HBBP68871 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HBBP68871 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HBBP68871 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HBBP68871 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HBBP68871 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HBBP68871 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HBBP68871 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HBBP68871 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HBBP68871 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HBBP68871 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HBBP68871 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HBBP68871 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HBBP68871 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HBBP68871 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HBBP68871 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HBBP68871 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HBBP68871 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HBBP68871 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HBBP68871 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HBBP68871 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HBBP68871 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms