Protein–RNA interactions for Protein: P63146

UBE2B, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2BP63146 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2BP63146 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2BP63146 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2BP63146 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2BP63146 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2BP63146 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms