Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
LSM3P62310 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LSM3P62310 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM3P62310 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM3P62310 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM3P62310 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM3P62310 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM3P62310 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM3P62310 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM3P62310 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM3P62310 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM3P62310 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM3P62310 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM3P62310 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM3P62310 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM3P62310 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM3P62310 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM3P62310 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM3P62310 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM3P62310 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM3P62310 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM3P62310 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM3P62310 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM3P62310 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM3P62310 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM3P62310 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM3P62310 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM3P62310 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM3P62310 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM3P62310 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM3P62310 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM3P62310 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM3P62310 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM3P62310 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM3P62310 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM3P62310 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM3P62310 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM3P62310 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM3P62310 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM3P62310 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM3P62310 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM3P62310 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM3P62310 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM3P62310 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM3P62310 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM3P62310 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM3P62310 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM3P62310 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM3P62310 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM3P62310 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM3P62310 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM3P62310 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM3P62310 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM3P62310 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM3P62310 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM3P62310 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM3P62310 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM3P62310 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM3P62310 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM3P62310 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM3P62310 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM3P62310 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM3P62310 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM3P62310 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM3P62310 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms