Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS3AP61247 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS3AP61247 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms