Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBP60709 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBP60709 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBP60709 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBP60709 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBP60709 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBP60709 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBP60709 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTBP60709 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTBP60709 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTBP60709 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTBP60709 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBP60709 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBP60709 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBP60709 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBP60709 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBP60709 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBP60709 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBP60709 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBP60709 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBP60709 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBP60709 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBP60709 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTBP60709 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTBP60709 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTBP60709 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTBP60709 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTBP60709 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTBP60709 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBP60709 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBP60709 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBP60709 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBP60709 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBP60709 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBP60709 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBP60709 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBP60709 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTBP60709 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTBP60709 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBP60709 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBP60709 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBP60709 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBP60709 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBP60709 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBP60709 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBP60709 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBP60709 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBP60709 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTBP60709 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTBP60709 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTBP60709 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTBP60709 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTBP60709 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBP60709 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBP60709 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBP60709 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBP60709 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBP60709 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBP60709 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBP60709 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTBP60709 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTBP60709 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTBP60709 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTBP60709 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTBP60709 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms