Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH13P55290 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH13P55290 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH13P55290 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH13P55290 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH13P55290 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH13P55290 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH13P55290 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH13P55290 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH13P55290 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH13P55290 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH13P55290 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH13P55290 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH13P55290 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH13P55290 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH13P55290 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH13P55290 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH13P55290 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH13P55290 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH13P55290 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH13P55290 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH13P55290 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH13P55290 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH13P55290 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH13P55290 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH13P55290 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH13P55290 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH13P55290 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH13P55290 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH13P55290 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH13P55290 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH13P55290 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH13P55290 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH13P55290 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH13P55290 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH13P55290 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH13P55290 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH13P55290 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH13P55290 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH13P55290 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH13P55290 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH13P55290 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH13P55290 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH13P55290 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH13P55290 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH13P55290 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH13P55290 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH13P55290 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH13P55290 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH13P55290 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH13P55290 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH13P55290 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH13P55290 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH13P55290 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH13P55290 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH13P55290 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH13P55290 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH13P55290 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH13P55290 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH13P55290 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH13P55290 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH13P55290 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH13P55290 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH13P55290 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH13P55290 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH13P55290 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH13P55290 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH13P55290 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH13P55290 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH13P55290 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH13P55290 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH13P55290 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH13P55290 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH13P55290 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH13P55290 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH13P55290 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH13P55290 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH13P55290 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH13P55290 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH13P55290 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH13P55290 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH13P55290 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms