Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NRLP54845 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRLP54845 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRLP54845 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRLP54845 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRLP54845 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRLP54845 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRLP54845 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRLP54845 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRLP54845 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRLP54845 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRLP54845 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRLP54845 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRLP54845 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRLP54845 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRLP54845 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRLP54845 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRLP54845 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRLP54845 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRLP54845 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRLP54845 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRLP54845 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRLP54845 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRLP54845 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRLP54845 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRLP54845 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRLP54845 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRLP54845 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRLP54845 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRLP54845 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRLP54845 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRLP54845 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NRLP54845 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRLP54845 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRLP54845 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRLP54845 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRLP54845 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRLP54845 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRLP54845 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRLP54845 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRLP54845 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRLP54845 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRLP54845 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRLP54845 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NRLP54845 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRLP54845 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRLP54845 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRLP54845 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRLP54845 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRLP54845 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRLP54845 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRLP54845 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRLP54845 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRLP54845 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRLP54845 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRLP54845 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRLP54845 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRLP54845 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRLP54845 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRLP54845 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRLP54845 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRLP54845 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRLP54845 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRLP54845 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRLP54845 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRLP54845 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRLP54845 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRLP54845 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRLP54845 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRLP54845 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRLP54845 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRLP54845 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRLP54845 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRLP54845 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRLP54845 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRLP54845 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRLP54845 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRLP54845 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRLP54845 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRLP54845 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRLP54845 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRLP54845 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRLP54845 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRLP54845 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms