Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPHB4P54760 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB4P54760 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB4P54760 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms