Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUBP1P53384 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUBP1P53384 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms