Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ETV1P50549 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ETV1P50549 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ETV1P50549 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ETV1P50549 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ETV1P50549 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ETV1P50549 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ETV1P50549 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ETV1P50549 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ETV1P50549 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ETV1P50549 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ETV1P50549 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ETV1P50549 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ETV1P50549 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ETV1P50549 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ETV1P50549 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ETV1P50549 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ETV1P50549 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ETV1P50549 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ETV1P50549 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ETV1P50549 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETV1P50549 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETV1P50549 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETV1P50549 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETV1P50549 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETV1P50549 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETV1P50549 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETV1P50549 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETV1P50549 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETV1P50549 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETV1P50549 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV1P50549 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV1P50549 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV1P50549 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV1P50549 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV1P50549 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV1P50549 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV1P50549 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV1P50549 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV1P50549 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ETV1P50549 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ETV1P50549 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ETV1P50549 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV1P50549 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV1P50549 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV1P50549 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV1P50549 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV1P50549 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV1P50549 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV1P50549 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV1P50549 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV1P50549 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV1P50549 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV1P50549 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV1P50549 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV1P50549 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV1P50549 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV1P50549 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV1P50549 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV1P50549 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV1P50549 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV1P50549 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV1P50549 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV1P50549 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV1P50549 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV1P50549 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV1P50549 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV1P50549 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV1P50549 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV1P50549 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV1P50549 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV1P50549 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV1P50549 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV1P50549 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV1P50549 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV1P50549 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV1P50549 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV1P50549 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV1P50549 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV1P50549 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV1P50549 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV1P50549 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV1P50549 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV1P50549 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV1P50549 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV1P50549 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV1P50549 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV1P50549 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV1P50549 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV1P50549 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms