Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC1P48995 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC1P48995 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms