Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A6P48664 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A6P48664 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A6P48664 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms