Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A9P48067 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A9P48067 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms