Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA4P48058 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA4P48058 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms