Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL21P46778 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL21P46778 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL21P46778 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL21P46778 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL21P46778 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL21P46778 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL21P46778 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL21P46778 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL21P46778 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL21P46778 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL21P46778 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL21P46778 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL21P46778 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL21P46778 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL21P46778 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL21P46778 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL21P46778 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL21P46778 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL21P46778 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL21P46778 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL21P46778 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL21P46778 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL21P46778 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL21P46778 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL21P46778 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL21P46778 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL21P46778 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL21P46778 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL21P46778 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL21P46778 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL21P46778 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL21P46778 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL21P46778 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL21P46778 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL21P46778 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL21P46778 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL21P46778 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL21P46778 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL21P46778 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL21P46778 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL21P46778 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL21P46778 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL21P46778 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL21P46778 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL21P46778 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL21P46778 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL21P46778 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL21P46778 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL21P46778 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL21P46778 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL21P46778 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL21P46778 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL21P46778 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL21P46778 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL21P46778 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL21P46778 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL21P46778 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL21P46778 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL21P46778 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL21P46778 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL21P46778 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL21P46778 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL21P46778 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL21P46778 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL21P46778 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL21P46778 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL21P46778 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL21P46778 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL21P46778 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL21P46778 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL21P46778 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL21P46778 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPL21P46778 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL21P46778 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL21P46778 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL21P46778 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL21P46778 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL21P46778 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL21P46778 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms