Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A2P43354 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms