Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL35P42766 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL35P42766 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL35P42766 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL35P42766 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL35P42766 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL35P42766 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL35P42766 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL35P42766 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL35P42766 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL35P42766 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL35P42766 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL35P42766 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL35P42766 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL35P42766 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL35P42766 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL35P42766 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL35P42766 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL35P42766 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL35P42766 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL35P42766 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL35P42766 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL35P42766 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL35P42766 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL35P42766 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL35P42766 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL35P42766 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL35P42766 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL35P42766 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL35P42766 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL35P42766 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL35P42766 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL35P42766 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL35P42766 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL35P42766 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL35P42766 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL35P42766 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL35P42766 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL35P42766 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL35P42766 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL35P42766 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL35P42766 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL35P42766 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL35P42766 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL35P42766 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL35P42766 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL35P42766 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL35P42766 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL35P42766 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL35P42766 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL35P42766 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL35P42766 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL35P42766 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL35P42766 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL35P42766 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL35P42766 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL35P42766 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL35P42766 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL35P42766 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL35P42766 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL35P42766 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL35P42766 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL35P42766 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL35P42766 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL35P42766 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL35P42766 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL35P42766 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL35P42766 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL35P42766 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL35P42766 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL35P42766 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL35P42766 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL35P42766 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL35P42766 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL35P42766 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL35P42766 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL35P42766 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL35P42766 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL35P42766 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL35P42766 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL35P42766 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL35P42766 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL35P42766 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL35P42766 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL35P42766 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms