Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3CBP42338 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CBP42338 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms