Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPHP41219 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPHP41219 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPHP41219 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPHP41219 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPHP41219 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPHP41219 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPHP41219 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPHP41219 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPHP41219 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPHP41219 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPHP41219 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPHP41219 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPHP41219 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPHP41219 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRPHP41219 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPHP41219 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPHP41219 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPHP41219 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPHP41219 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPHP41219 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPHP41219 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPHP41219 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPHP41219 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPHP41219 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPHP41219 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPHP41219 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPHP41219 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPHP41219 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPHP41219 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPHP41219 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPHP41219 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPHP41219 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPHP41219 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPHP41219 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPHP41219 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPHP41219 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPHP41219 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPHP41219 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPHP41219 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPHP41219 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPHP41219 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPHP41219 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPHP41219 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPHP41219 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPHP41219 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPHP41219 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPHP41219 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPHP41219 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPHP41219 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPHP41219 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPHP41219 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPHP41219 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPHP41219 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPHP41219 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPHP41219 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPHP41219 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPHP41219 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPHP41219 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPHP41219 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPHP41219 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPHP41219 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPHP41219 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPHP41219 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPHP41219 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPHP41219 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPHP41219 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPHP41219 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPHP41219 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPHP41219 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPHP41219 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPHP41219 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPHP41219 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPHP41219 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPHP41219 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPHP41219 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPHP41219 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPHP41219 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPHP41219 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPHP41219 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPHP41219 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPHP41219 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPHP41219 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPHP41219 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPHP41219 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPHP41219 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPHP41219 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPHP41219 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPHP41219 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms