Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASRP41180 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASRP41180 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASRP41180 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASRP41180 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASRP41180 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASRP41180 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASRP41180 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASRP41180 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASRP41180 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASRP41180 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASRP41180 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASRP41180 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASRP41180 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASRP41180 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASRP41180 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASRP41180 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASRP41180 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASRP41180 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASRP41180 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASRP41180 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASRP41180 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASRP41180 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASRP41180 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASRP41180 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASRP41180 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASRP41180 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASRP41180 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASRP41180 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASRP41180 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASRP41180 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASRP41180 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASRP41180 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASRP41180 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASRP41180 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASRP41180 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASRP41180 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASRP41180 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASRP41180 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASRP41180 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASRP41180 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASRP41180 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASRP41180 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASRP41180 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASRP41180 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASRP41180 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASRP41180 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASRP41180 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASRP41180 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASRP41180 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASRP41180 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASRP41180 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASRP41180 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASRP41180 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASRP41180 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASRP41180 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASRP41180 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASRP41180 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASRP41180 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASRP41180 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASRP41180 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASRP41180 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASRP41180 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASRP41180 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASRP41180 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASRP41180 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASRP41180 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASRP41180 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASRP41180 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASRP41180 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASRP41180 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASRP41180 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASRP41180 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASRP41180 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASRP41180 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASRP41180 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASRP41180 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASRP41180 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASRP41180 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASRP41180 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASRP41180 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASRP41180 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASRP41180 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASRP41180 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASRP41180 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASRP41180 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASRP41180 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASRP41180 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASRP41180 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASRP41180 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASRP41180 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASRP41180 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASRP41180 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASRP41180 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASRP41180 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASRP41180 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASRP41180 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASRP41180 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASRP41180 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASRP41180 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms