Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL13AP40429 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms