Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA9P38646 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSPA9P38646 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms