Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RDXP35241 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RDXP35241 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RDXP35241 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RDXP35241 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RDXP35241 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RDXP35241 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RDXP35241 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RDXP35241 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RDXP35241 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RDXP35241 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RDXP35241 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RDXP35241 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RDXP35241 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RDXP35241 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RDXP35241 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RDXP35241 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RDXP35241 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RDXP35241 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RDXP35241 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RDXP35241 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDXP35241 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDXP35241 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDXP35241 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDXP35241 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDXP35241 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDXP35241 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDXP35241 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDXP35241 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDXP35241 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDXP35241 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDXP35241 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDXP35241 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDXP35241 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDXP35241 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RDXP35241 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RDXP35241 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDXP35241 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDXP35241 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDXP35241 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDXP35241 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDXP35241 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDXP35241 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDXP35241 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDXP35241 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RDXP35241 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDXP35241 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDXP35241 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDXP35241 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDXP35241 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDXP35241 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDXP35241 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDXP35241 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDXP35241 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDXP35241 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDXP35241 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDXP35241 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDXP35241 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDXP35241 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDXP35241 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDXP35241 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDXP35241 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDXP35241 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDXP35241 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RDXP35241 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RDXP35241 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RDXP35241 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDXP35241 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDXP35241 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDXP35241 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDXP35241 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDXP35241 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDXP35241 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDXP35241 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDXP35241 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDXP35241 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RDXP35241 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDXP35241 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDXP35241 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDXP35241 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDXP35241 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RDXP35241 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDXP35241 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDXP35241 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDXP35241 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDXP35241 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDXP35241 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDXP35241 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDXP35241 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDXP35241 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms