Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFN2P35080 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFN2P35080 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFN2P35080 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFN2P35080 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PFN2P35080 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PFN2P35080 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFN2P35080 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFN2P35080 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFN2P35080 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFN2P35080 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFN2P35080 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFN2P35080 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFN2P35080 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFN2P35080 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFN2P35080 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFN2P35080 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFN2P35080 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFN2P35080 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFN2P35080 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFN2P35080 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFN2P35080 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFN2P35080 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFN2P35080 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFN2P35080 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFN2P35080 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFN2P35080 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFN2P35080 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFN2P35080 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFN2P35080 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFN2P35080 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFN2P35080 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFN2P35080 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFN2P35080 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFN2P35080 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFN2P35080 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFN2P35080 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFN2P35080 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFN2P35080 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFN2P35080 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PFN2P35080 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFN2P35080 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFN2P35080 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFN2P35080 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFN2P35080 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFN2P35080 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFN2P35080 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms