Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDH5P33151 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH5P33151 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH5P33151 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH5P33151 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH5P33151 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH5P33151 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH5P33151 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH5P33151 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH5P33151 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH5P33151 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH5P33151 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH5P33151 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH5P33151 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH5P33151 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH5P33151 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH5P33151 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH5P33151 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH5P33151 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH5P33151 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH5P33151 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH5P33151 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH5P33151 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH5P33151 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH5P33151 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH5P33151 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH5P33151 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH5P33151 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH5P33151 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH5P33151 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDH5P33151 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH5P33151 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH5P33151 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH5P33151 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH5P33151 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH5P33151 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH5P33151 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH5P33151 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH5P33151 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH5P33151 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH5P33151 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH5P33151 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH5P33151 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH5P33151 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH5P33151 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH5P33151 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH5P33151 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH5P33151 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH5P33151 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH5P33151 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH5P33151 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH5P33151 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH5P33151 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH5P33151 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH5P33151 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH5P33151 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH5P33151 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH5P33151 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH5P33151 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH5P33151 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH5P33151 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH5P33151 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH5P33151 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH5P33151 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH5P33151 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH5P33151 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH5P33151 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH5P33151 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH5P33151 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH5P33151 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH5P33151 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH5P33151 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH5P33151 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH5P33151 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH5P33151 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH5P33151 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH5P33151 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH5P33151 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH5P33151 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH5P33151 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH5P33151 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH5P33151 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH5P33151 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH5P33151 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH5P33151 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH5P33151 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH5P33151 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH5P33151 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH5P33151 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH5P33151 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH5P33151 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH5P33151 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH5P33151 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH5P33151 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH5P33151 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH5P33151 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH5P33151 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH5P33151 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH5P33151 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH5P33151 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms