Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms