Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
YY1P25490 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
YY1P25490 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
YY1P25490 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
YY1P25490 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
YY1P25490 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
YY1P25490 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
YY1P25490 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
YY1P25490 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
YY1P25490 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
YY1P25490 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
YY1P25490 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
YY1P25490 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
YY1P25490 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
YY1P25490 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
YY1P25490 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
YY1P25490 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
YY1P25490 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
YY1P25490 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
YY1P25490 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
YY1P25490 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
YY1P25490 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
YY1P25490 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
YY1P25490 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
YY1P25490 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
YY1P25490 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
YY1P25490 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
YY1P25490 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
YY1P25490 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
YY1P25490 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
YY1P25490 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
YY1P25490 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
YY1P25490 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
YY1P25490 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
YY1P25490 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
YY1P25490 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
YY1P25490 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
YY1P25490 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
YY1P25490 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
YY1P25490 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
YY1P25490 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
YY1P25490 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
YY1P25490 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
YY1P25490 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
YY1P25490 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
YY1P25490 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
YY1P25490 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
YY1P25490 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
YY1P25490 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
YY1P25490 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
YY1P25490 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
YY1P25490 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
YY1P25490 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
YY1P25490 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
YY1P25490 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
YY1P25490 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
YY1P25490 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
YY1P25490 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
YY1P25490 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
YY1P25490 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
YY1P25490 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
YY1P25490 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
YY1P25490 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
YY1P25490 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
YY1P25490 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
YY1P25490 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
YY1P25490 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
YY1P25490 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
YY1P25490 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
YY1P25490 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
YY1P25490 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
YY1P25490 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
YY1P25490 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
YY1P25490 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
YY1P25490 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
YY1P25490 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
YY1P25490 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
YY1P25490 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
YY1P25490 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
YY1P25490 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
YY1P25490 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
YY1P25490 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
YY1P25490 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
YY1P25490 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
YY1P25490 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
YY1P25490 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
YY1P25490 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
YY1P25490 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
YY1P25490 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
YY1P25490 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
YY1P25490 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
YY1P25490 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
YY1P25490 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
YY1P25490 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
YY1P25490 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
YY1P25490 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
YY1P25490 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
YY1P25490 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
YY1P25490 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
YY1P25490 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms