Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMPD1P23109 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMPD1P23109 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMPD1P23109 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMPD1P23109 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMPD1P23109 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms