Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RFX1P22670 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RFX1P22670 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFX1P22670 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFX1P22670 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFX1P22670 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFX1P22670 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFX1P22670 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFX1P22670 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFX1P22670 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFX1P22670 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFX1P22670 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFX1P22670 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFX1P22670 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFX1P22670 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFX1P22670 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFX1P22670 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFX1P22670 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFX1P22670 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFX1P22670 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFX1P22670 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFX1P22670 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFX1P22670 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFX1P22670 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFX1P22670 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFX1P22670 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RFX1P22670 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFX1P22670 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFX1P22670 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFX1P22670 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFX1P22670 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFX1P22670 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFX1P22670 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFX1P22670 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFX1P22670 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFX1P22670 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFX1P22670 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFX1P22670 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFX1P22670 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFX1P22670 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFX1P22670 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFX1P22670 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RFX1P22670 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFX1P22670 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFX1P22670 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFX1P22670 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFX1P22670 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFX1P22670 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFX1P22670 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RFX1P22670 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFX1P22670 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFX1P22670 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RFX1P22670 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RFX1P22670 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFX1P22670 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFX1P22670 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX1P22670 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX1P22670 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX1P22670 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX1P22670 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX1P22670 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX1P22670 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX1P22670 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX1P22670 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX1P22670 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFX1P22670 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFX1P22670 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFX1P22670 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFX1P22670 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFX1P22670 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFX1P22670 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFX1P22670 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFX1P22670 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFX1P22670 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFX1P22670 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFX1P22670 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFX1P22670 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFX1P22670 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFX1P22670 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFX1P22670 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFX1P22670 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFX1P22670 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFX1P22670 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFX1P22670 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFX1P22670 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFX1P22670 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFX1P22670 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFX1P22670 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFX1P22670 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFX1P22670 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RFX1P22670 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RFX1P22670 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX1P22670 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX1P22670 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX1P22670 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX1P22670 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX1P22670 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX1P22670 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX1P22670 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX1P22670 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms