Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP2B1P20020 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2B1P20020 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2B1P20020 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms