Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN8P19075 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN8P19075 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN8P19075 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms