Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT4P19013 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT4P19013 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT4P19013 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT4P19013 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT4P19013 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT4P19013 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT4P19013 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT4P19013 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT4P19013 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT4P19013 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT4P19013 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT4P19013 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT4P19013 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT4P19013 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT4P19013 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT4P19013 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT4P19013 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT4P19013 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT4P19013 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT4P19013 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT4P19013 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT4P19013 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT4P19013 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT4P19013 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT4P19013 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT4P19013 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT4P19013 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT4P19013 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT4P19013 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT4P19013 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT4P19013 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT4P19013 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT4P19013 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT4P19013 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT4P19013 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT4P19013 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT4P19013 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT4P19013 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT4P19013 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT4P19013 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT4P19013 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT4P19013 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT4P19013 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT4P19013 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT4P19013 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT4P19013 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT4P19013 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT4P19013 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT4P19013 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT4P19013 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT4P19013 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT4P19013 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT4P19013 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT4P19013 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT4P19013 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT4P19013 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT4P19013 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT4P19013 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT4P19013 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT4P19013 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT4P19013 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT4P19013 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT4P19013 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT4P19013 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT4P19013 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT4P19013 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT4P19013 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT4P19013 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT4P19013 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT4P19013 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT4P19013 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT4P19013 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT4P19013 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT4P19013 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT4P19013 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT4P19013 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT4P19013 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT4P19013 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT4P19013 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT4P19013 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT4P19013 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT4P19013 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT4P19013 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT4P19013 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT4P19013 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT4P19013 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT4P19013 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT4P19013 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT4P19013 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT4P19013 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms