Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LBPP18428 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LBPP18428 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LBPP18428 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LBPP18428 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LBPP18428 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LBPP18428 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBPP18428 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBPP18428 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBPP18428 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBPP18428 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBPP18428 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBPP18428 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBPP18428 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBPP18428 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBPP18428 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBPP18428 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBPP18428 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBPP18428 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBPP18428 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBPP18428 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LBPP18428 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBPP18428 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBPP18428 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBPP18428 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LBPP18428 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LBPP18428 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBPP18428 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBPP18428 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBPP18428 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBPP18428 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBPP18428 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBPP18428 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBPP18428 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBPP18428 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBPP18428 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBPP18428 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBPP18428 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBPP18428 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBPP18428 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBPP18428 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBPP18428 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBPP18428 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBPP18428 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBPP18428 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBPP18428 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBPP18428 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBPP18428 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBPP18428 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBPP18428 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBPP18428 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBPP18428 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBPP18428 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBPP18428 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LBPP18428 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LBPP18428 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LBPP18428 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LBPP18428 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LBPP18428 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LBPP18428 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LBPP18428 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LBPP18428 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LBPP18428 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LBPP18428 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms