Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLS3P13797 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLS3P13797 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PLS3P13797 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLS3P13797 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLS3P13797 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLS3P13797 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLS3P13797 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLS3P13797 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLS3P13797 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLS3P13797 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLS3P13797 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLS3P13797 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLS3P13797 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLS3P13797 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLS3P13797 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLS3P13797 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLS3P13797 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLS3P13797 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLS3P13797 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLS3P13797 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLS3P13797 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PLS3P13797 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLS3P13797 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLS3P13797 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLS3P13797 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLS3P13797 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLS3P13797 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLS3P13797 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLS3P13797 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLS3P13797 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLS3P13797 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLS3P13797 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLS3P13797 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLS3P13797 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLS3P13797 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLS3P13797 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLS3P13797 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLS3P13797 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLS3P13797 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLS3P13797 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PLS3P13797 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLS3P13797 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLS3P13797 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLS3P13797 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLS3P13797 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLS3P13797 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLS3P13797 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLS3P13797 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLS3P13797 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLS3P13797 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLS3P13797 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLS3P13797 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLS3P13797 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLS3P13797 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLS3P13797 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLS3P13797 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLS3P13797 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLS3P13797 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLS3P13797 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLS3P13797 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PLS3P13797 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLS3P13797 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLS3P13797 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLS3P13797 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLS3P13797 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLS3P13797 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PLS3P13797 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLS3P13797 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PLS3P13797 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLS3P13797 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLS3P13797 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLS3P13797 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLS3P13797 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLS3P13797 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLS3P13797 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLS3P13797 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLS3P13797 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLS3P13797 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLS3P13797 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLS3P13797 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLS3P13797 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLS3P13797 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PLS3P13797 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLS3P13797 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLS3P13797 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLS3P13797 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLS3P13797 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLS3P13797 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLS3P13797 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLS3P13797 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLS3P13797 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLS3P13797 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLS3P13797 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLS3P13797 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLS3P13797 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PLS3P13797 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLS3P13797 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLS3P13797 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLS3P13797 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms