Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT13P13646 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT13P13646 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT13P13646 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT13P13646 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT13P13646 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT13P13646 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT13P13646 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT13P13646 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT13P13646 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT13P13646 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT13P13646 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT13P13646 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT13P13646 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT13P13646 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT13P13646 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT13P13646 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT13P13646 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT13P13646 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT13P13646 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT13P13646 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT13P13646 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT13P13646 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT13P13646 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT13P13646 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT13P13646 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT13P13646 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT13P13646 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT13P13646 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT13P13646 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT13P13646 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT13P13646 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT13P13646 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT13P13646 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT13P13646 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT13P13646 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT13P13646 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT13P13646 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT13P13646 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT13P13646 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT13P13646 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT13P13646 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT13P13646 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT13P13646 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT13P13646 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT13P13646 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT13P13646 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT13P13646 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT13P13646 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT13P13646 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT13P13646 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT13P13646 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT13P13646 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT13P13646 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT13P13646 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT13P13646 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT13P13646 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT13P13646 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT13P13646 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT13P13646 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT13P13646 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT13P13646 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT13P13646 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT13P13646 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT13P13646 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT13P13646 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT13P13646 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT13P13646 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT13P13646 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT13P13646 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT13P13646 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT13P13646 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT13P13646 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT13P13646 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT13P13646 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT13P13646 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT13P13646 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT13P13646 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT13P13646 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT13P13646 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT13P13646 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT13P13646 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT13P13646 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT13P13646 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT13P13646 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT13P13646 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT13P13646 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT13P13646 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT13P13646 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT13P13646 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT13P13646 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms