Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAM1P13591 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAM1P13591 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms