Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XRCC5P13010 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XRCC5P13010 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms