Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CKBP12277 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKBP12277 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKBP12277 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CKBP12277 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKBP12277 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKBP12277 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CKBP12277 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKBP12277 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKBP12277 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKBP12277 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKBP12277 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKBP12277 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKBP12277 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKBP12277 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKBP12277 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKBP12277 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKBP12277 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKBP12277 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKBP12277 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKBP12277 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKBP12277 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKBP12277 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKBP12277 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKBP12277 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKBP12277 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKBP12277 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKBP12277 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKBP12277 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CKBP12277 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CKBP12277 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CKBP12277 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CKBP12277 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKBP12277 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKBP12277 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKBP12277 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CKBP12277 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKBP12277 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKBP12277 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKBP12277 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKBP12277 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKBP12277 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKBP12277 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKBP12277 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKBP12277 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKBP12277 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKBP12277 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKBP12277 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CKBP12277 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKBP12277 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKBP12277 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKBP12277 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKBP12277 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKBP12277 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CKBP12277 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKBP12277 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKBP12277 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKBP12277 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKBP12277 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKBP12277 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKBP12277 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CKBP12277 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CKBP12277 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKBP12277 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKBP12277 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKBP12277 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKBP12277 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKBP12277 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKBP12277 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CKBP12277 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKBP12277 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKBP12277 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CKBP12277 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKBP12277 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKBP12277 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKBP12277 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKBP12277 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKBP12277 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKBP12277 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKBP12277 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKBP12277 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKBP12277 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKBP12277 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKBP12277 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CKBP12277 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKBP12277 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKBP12277 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKBP12277 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKBP12277 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKBP12277 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms