Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT3P12035 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT3P12035 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT3P12035 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT3P12035 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT3P12035 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT3P12035 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT3P12035 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT3P12035 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT3P12035 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT3P12035 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT3P12035 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT3P12035 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT3P12035 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT3P12035 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT3P12035 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT3P12035 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT3P12035 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT3P12035 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT3P12035 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT3P12035 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT3P12035 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT3P12035 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT3P12035 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT3P12035 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT3P12035 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT3P12035 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT3P12035 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT3P12035 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT3P12035 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT3P12035 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT3P12035 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT3P12035 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT3P12035 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT3P12035 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT3P12035 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT3P12035 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT3P12035 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT3P12035 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT3P12035 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT3P12035 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT3P12035 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT3P12035 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT3P12035 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT3P12035 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT3P12035 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT3P12035 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT3P12035 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT3P12035 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT3P12035 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT3P12035 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT3P12035 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT3P12035 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT3P12035 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT3P12035 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT3P12035 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT3P12035 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT3P12035 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT3P12035 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT3P12035 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT3P12035 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT3P12035 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT3P12035 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT3P12035 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT3P12035 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT3P12035 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT3P12035 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT3P12035 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT3P12035 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT3P12035 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT3P12035 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT3P12035 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT3P12035 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT3P12035 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT3P12035 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT3P12035 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT3P12035 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT3P12035 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT3P12035 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT3P12035 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT3P12035 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT3P12035 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT3P12035 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT3P12035 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT3P12035 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT3P12035 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT3P12035 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT3P12035 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT3P12035 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT3P12035 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms