Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VDRP11473 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VDRP11473 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VDRP11473 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VDRP11473 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VDRP11473 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VDRP11473 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VDRP11473 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VDRP11473 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VDRP11473 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VDRP11473 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VDRP11473 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VDRP11473 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VDRP11473 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VDRP11473 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VDRP11473 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VDRP11473 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VDRP11473 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VDRP11473 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VDRP11473 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VDRP11473 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VDRP11473 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VDRP11473 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VDRP11473 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VDRP11473 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VDRP11473 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VDRP11473 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VDRP11473 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VDRP11473 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VDRP11473 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VDRP11473 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VDRP11473 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VDRP11473 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VDRP11473 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VDRP11473 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VDRP11473 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VDRP11473 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VDRP11473 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VDRP11473 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VDRP11473 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VDRP11473 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VDRP11473 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VDRP11473 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VDRP11473 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VDRP11473 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VDRP11473 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VDRP11473 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VDRP11473 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VDRP11473 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VDRP11473 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VDRP11473 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VDRP11473 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VDRP11473 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VDRP11473 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VDRP11473 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VDRP11473 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VDRP11473 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VDRP11473 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VDRP11473 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
VDRP11473 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VDRP11473 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VDRP11473 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VDRP11473 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VDRP11473 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VDRP11473 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VDRP11473 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VDRP11473 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VDRP11473 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VDRP11473 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VDRP11473 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VDRP11473 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VDRP11473 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VDRP11473 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VDRP11473 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VDRP11473 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VDRP11473 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VDRP11473 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VDRP11473 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VDRP11473 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VDRP11473 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VDRP11473 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VDRP11473 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VDRP11473 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VDRP11473 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VDRP11473 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VDRP11473 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VDRP11473 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VDRP11473 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VDRP11473 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VDRP11473 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VDRP11473 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VDRP11473 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VDRP11473 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VDRP11473 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VDRP11473 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VDRP11473 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VDRP11473 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VDRP11473 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms