Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP3P10745 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP3P10745 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP3P10745 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP3P10745 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP3P10745 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP3P10745 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP3P10745 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP3P10745 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP3P10745 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP3P10745 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP3P10745 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP3P10745 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP3P10745 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP3P10745 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP3P10745 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP3P10745 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBP3P10745 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBP3P10745 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBP3P10745 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBP3P10745 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP3P10745 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP3P10745 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP3P10745 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP3P10745 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP3P10745 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP3P10745 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP3P10745 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP3P10745 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP3P10745 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP3P10745 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP3P10745 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP3P10745 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP3P10745 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP3P10745 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP3P10745 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP3P10745 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP3P10745 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP3P10745 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP3P10745 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP3P10745 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP3P10745 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP3P10745 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP3P10745 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP3P10745 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP3P10745 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP3P10745 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP3P10745 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP3P10745 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP3P10745 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP3P10745 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP3P10745 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP3P10745 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP3P10745 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP3P10745 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP3P10745 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP3P10745 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP3P10745 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBP3P10745 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP3P10745 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP3P10745 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP3P10745 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP3P10745 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP3P10745 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP3P10745 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP3P10745 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP3P10745 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP3P10745 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP3P10745 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP3P10745 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP3P10745 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP3P10745 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP3P10745 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP3P10745 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP3P10745 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP3P10745 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP3P10745 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP3P10745 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP3P10745 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP3P10745 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP3P10745 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP3P10745 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP3P10745 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP3P10745 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP3P10745 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP3P10745 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP3P10745 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP3P10745 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms