Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARAFP10398 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARAFP10398 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARAFP10398 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARAFP10398 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARAFP10398 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARAFP10398 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARAFP10398 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARAFP10398 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARAFP10398 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARAFP10398 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARAFP10398 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARAFP10398 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARAFP10398 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARAFP10398 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARAFP10398 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARAFP10398 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARAFP10398 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARAFP10398 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARAFP10398 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARAFP10398 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARAFP10398 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARAFP10398 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARAFP10398 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARAFP10398 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARAFP10398 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARAFP10398 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARAFP10398 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARAFP10398 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARAFP10398 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARAFP10398 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARAFP10398 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARAFP10398 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARAFP10398 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARAFP10398 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARAFP10398 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARAFP10398 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARAFP10398 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARAFP10398 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARAFP10398 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARAFP10398 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARAFP10398 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARAFP10398 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARAFP10398 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARAFP10398 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARAFP10398 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARAFP10398 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARAFP10398 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARAFP10398 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARAFP10398 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARAFP10398 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARAFP10398 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARAFP10398 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARAFP10398 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARAFP10398 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARAFP10398 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARAFP10398 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARAFP10398 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARAFP10398 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARAFP10398 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARAFP10398 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARAFP10398 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARAFP10398 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARAFP10398 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARAFP10398 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARAFP10398 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARAFP10398 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARAFP10398 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARAFP10398 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARAFP10398 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARAFP10398 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARAFP10398 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARAFP10398 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARAFP10398 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARAFP10398 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARAFP10398 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARAFP10398 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARAFP10398 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARAFP10398 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARAFP10398 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARAFP10398 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARAFP10398 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARAFP10398 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARAFP10398 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARAFP10398 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARAFP10398 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARAFP10398 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARAFP10398 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARAFP10398 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARAFP10398 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms