Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARAP10276 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARAP10276 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARAP10276 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARAP10276 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARAP10276 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARAP10276 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARAP10276 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARAP10276 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARAP10276 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARAP10276 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARAP10276 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARAP10276 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARAP10276 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARAP10276 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARAP10276 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARAP10276 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARAP10276 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARAP10276 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARAP10276 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARAP10276 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARAP10276 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARAP10276 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARAP10276 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RARAP10276 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARAP10276 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARAP10276 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARAP10276 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RARAP10276 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARAP10276 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARAP10276 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARAP10276 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARAP10276 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARAP10276 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARAP10276 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARAP10276 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARAP10276 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RARAP10276 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARAP10276 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARAP10276 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARAP10276 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARAP10276 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARAP10276 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARAP10276 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARAP10276 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARAP10276 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARAP10276 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RARAP10276 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RARAP10276 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARAP10276 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARAP10276 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARAP10276 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARAP10276 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARAP10276 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARAP10276 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARAP10276 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARAP10276 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARAP10276 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARAP10276 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARAP10276 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARAP10276 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARAP10276 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARAP10276 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARAP10276 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARAP10276 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARAP10276 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARAP10276 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARAP10276 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARAP10276 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RARAP10276 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARAP10276 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARAP10276 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARAP10276 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARAP10276 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARAP10276 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARAP10276 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARAP10276 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARAP10276 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RARAP10276 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RARAP10276 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARAP10276 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARAP10276 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARAP10276 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARAP10276 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARAP10276 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARAP10276 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARAP10276 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARAP10276 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARAP10276 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARAP10276 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARAP10276 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms