Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HKR1P10072 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HKR1P10072 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HKR1P10072 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HKR1P10072 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HKR1P10072 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HKR1P10072 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HKR1P10072 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HKR1P10072 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HKR1P10072 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HKR1P10072 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HKR1P10072 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HKR1P10072 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HKR1P10072 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HKR1P10072 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HKR1P10072 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HKR1P10072 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HKR1P10072 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HKR1P10072 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HKR1P10072 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HKR1P10072 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HKR1P10072 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HKR1P10072 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HKR1P10072 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HKR1P10072 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HKR1P10072 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HKR1P10072 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HKR1P10072 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HKR1P10072 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HKR1P10072 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HKR1P10072 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HKR1P10072 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HKR1P10072 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HKR1P10072 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HKR1P10072 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HKR1P10072 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HKR1P10072 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HKR1P10072 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HKR1P10072 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HKR1P10072 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HKR1P10072 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HKR1P10072 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HKR1P10072 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HKR1P10072 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HKR1P10072 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HKR1P10072 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HKR1P10072 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HKR1P10072 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HKR1P10072 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HKR1P10072 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HKR1P10072 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HKR1P10072 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HKR1P10072 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HKR1P10072 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HKR1P10072 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HKR1P10072 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HKR1P10072 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HKR1P10072 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HKR1P10072 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HKR1P10072 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HKR1P10072 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HKR1P10072 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HKR1P10072 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HKR1P10072 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HKR1P10072 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HKR1P10072 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HKR1P10072 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HKR1P10072 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HKR1P10072 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HKR1P10072 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HKR1P10072 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HKR1P10072 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms