Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM18P0DKX4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM18P0DKX4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms